Protein–RNA interactions for Protein: Q8K448

Abca5, ATP-binding cassette sub-family A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca5Q8K448 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abca5Q8K448 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca5Q8K448 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abca5Q8K448 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms