Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms