Protein–RNA interactions for Protein: Q8K368

Fanci, Fanconi anemia group I protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanciQ8K368 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FanciQ8K368 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FanciQ8K368 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FanciQ8K368 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FanciQ8K368 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FanciQ8K368 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FanciQ8K368 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FanciQ8K368 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FanciQ8K368 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FanciQ8K368 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FanciQ8K368 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FanciQ8K368 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FanciQ8K368 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FanciQ8K368 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FanciQ8K368 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FanciQ8K368 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FanciQ8K368 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms