Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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