Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Alkbh3Q8K1E6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alkbh3Q8K1E6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alkbh3Q8K1E6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh3Q8K1E6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms