Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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