Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setd1bQ8CFT2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Setd1bQ8CFT2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms