Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup88Q8CEC0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms