Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms