Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc22Q8C5N3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc22Q8C5N3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc22Q8C5N3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc22Q8C5N3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc22Q8C5N3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cwc22Q8C5N3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 295.4 ms