Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Znf428Q8C1M2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Znf428Q8C1M2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Znf428Q8C1M2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Znf428Q8C1M2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Znf428Q8C1M2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms