Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.7 ms