Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms