Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem87bQ8BKU8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms