Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms