Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan9Q8BJU2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan9Q8BJU2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms