Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prune1Q8BIW1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prune1Q8BIW1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms