Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rufy1Q8BIJ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy1Q8BIJ7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms