Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Susd4Q8BH32 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms