Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pknox2Q8BG99 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pknox2Q8BG99 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms