Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp4Q8BFV3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp4Q8BFV3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms