Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Jmjd4Q8BFT6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms