Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cldn34b3Q80ZS5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cldn34b3Q80ZS5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Cldn34b3Q80ZS5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms