Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc155Q80VJ8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms