Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep170bQ80U49 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms