Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdc42bpbQ7TT50 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdc42bpbQ7TT50 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdc42bpbQ7TT50 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdc42bpbQ7TT50 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdc42bpbQ7TT50 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdc42bpbQ7TT50 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdc42bpbQ7TT50 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdc42bpbQ7TT50 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdc42bpbQ7TT50 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdc42bpbQ7TT50 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms