Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms