Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrc2bQ7TPM1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prrc2bQ7TPM1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms