Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nup188Q6ZQH8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup188Q6ZQH8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms