Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nemp1Q6ZQE4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms