Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm3bQ6ZPY7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm3bQ6ZPY7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm3bQ6ZPY7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms