Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Asic1Q6NXK8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic1Q6NXK8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic1Q6NXK8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic1Q6NXK8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic1Q6NXK8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic1Q6NXK8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic1Q6NXK8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic1Q6NXK8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic1Q6NXK8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic1Q6NXK8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic1Q6NXK8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic1Q6NXK8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic1Q6NXK8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic1Q6NXK8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic1Q6NXK8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms