Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc3bQ6NWW9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc3bQ6NWW9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms