Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn11Q6J756 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms