Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hecw2Q6I6G8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hecw2Q6I6G8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hecw2Q6I6G8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms