Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ScapQ6GQT6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScapQ6GQT6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScapQ6GQT6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ScapQ6GQT6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScapQ6GQT6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScapQ6GQT6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScapQ6GQT6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScapQ6GQT6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScapQ6GQT6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScapQ6GQT6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScapQ6GQT6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScapQ6GQT6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScapQ6GQT6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScapQ6GQT6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScapQ6GQT6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ScapQ6GQT6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ScapQ6GQT6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms