Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Carmil1Q6EDY6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Carmil1Q6EDY6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms