Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Smarca2Q6DIC0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Smarca2Q6DIC0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Smarca2Q6DIC0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Smarca2Q6DIC0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Smarca2Q6DIC0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Smarca2Q6DIC0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms