Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ltn1Q6A009 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ltn1Q6A009 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ltn1Q6A009 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ltn1Q6A009 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Ltn1Q6A009 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ltn1Q6A009 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Ltn1Q6A009 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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Ltn1Q6A009 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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Ltn1Q6A009 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Ltn1Q6A009 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Ltn1Q6A009 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
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