Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms