Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sbno1Q689Z5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms