Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp4eQ66X19 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms