Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf4Q64310 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms