Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pan3Q640Q5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pan3Q640Q5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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