Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms