Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Supt6hQ62383 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Supt6hQ62383 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Supt6hQ62383 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Supt6hQ62383 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Supt6hQ62383 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Supt6hQ62383 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Supt6hQ62383 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Supt6hQ62383 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt6hQ62383 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms