Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms