Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rbm38Q62176 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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