Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gli3Q61602 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms