Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JrkQ60976 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JrkQ60976 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
JrkQ60976 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JrkQ60976 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JrkQ60976 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JrkQ60976 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JrkQ60976 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JrkQ60976 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
JrkQ60976 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JrkQ60976 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms